A comparison of cluster analysis methods using DNA methylation data
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
A comparison of cluster analysis methods using DNA methylation data
MOTIVATION Aberrant DNA methylation is common in cancer. DNA methylation profiles differ between tumor types and subtypes and provide a powerful diagnostic tool for identifying clusters of samples and/or genes. DNA methylation data obtained with the quantitative, highly sensitive MethyLight technology is not normally distributed; it frequently contains an excess of zeros. Established tools to a...
متن کاملcomparative dna interaction studies of antiviral drug, zidovudine and its complex using different instrumental methods
هدف از این مطالعه بررسی امکان استفاده از داروهای شناخته شده در درمان سایر بیماریها به عنوان داروهای ضد سرطان است. همچنین با استفاده از این داروها در ساختمان کمپلکس فلز می توان شاخص های دارویی بدست آمده را بررسی نمود. داروی ضد ویروس ایدز(hiv)به نام زیدوودین(azt)انتخاب و.کمپلکس.محلول.در.آب[pt(azt)2]cl2سنتزو به روشهای مختلف فیزیکی و شیمیایی شناسایی گردید. بر هم کنش مقایسه ای این دارو و کمپلکس پلا...
15 صفحه اولRnBeads – Comprehensive Analysis of DNA Methylation Data
RnBeads is an R package for the comprehensive analysis of genome-wide DNA methylation data with single basepair resolution. Supported assays include the Infinium 450k microarray, whole genome bisulfite sequencing (WGBS), reduced representation bisulfite sequencing (RRBS), other forms of enrichment bisulfite sequencing, and any other large-scale method that can provide DNA methylation data at si...
متن کاملTCGA COAD/READ DNA Methylation Data Analysis
[1] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.1.2.0" [2] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.2.2.0" [3] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.3.1.0" [4] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.4.1.0" [5] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.5.2.0" [6] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.6.0.0" [7] "jhu-usc.edu_COAD.HumanMethylation27.Level_3.7.0.0" [8] "...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2004
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/bth176